Природа Светог Духа је тема у којој постоји значајна разлика између стандардне хришћанске теологије и нове хришћанске перспективе. „Званична“ догма већине хришћанских учења је да је Свети Дух једна од три особе које чине једног Бога, у улози да допре до људи са Божјом моћи да их доведе у жељу за праведношћу. Сматра се да он потиче од друга два: Бога Оца и Исуса Сина.
Та стара формулација била је резултат тровековне расправе међу раним хришћанима, док су покушавали да разумеју природу Бога. У то време, постојала је значајна мањина која је одбацила став о Богу у три особе, али -- већина је победила, на сабору у Никеји, 325. године нове ере.
Ново хришћанско учење је сличније неким старим мањинским гледиштима. Она сматра Светог Духа силом, или активношћу, која долази од Бога - а не одвојеним бићем. Ово је у складу са нашим свакодневним схватањем „духа“ као пројекције нечије личности. То такође објашњава чињеницу да се израз „Свети Дух“ не појављује у Старом завету, који уместо тога користи изразе као што су „дух Божји“, „дух Јеховин“ и „дух Господњи“, где идеја духа тесно повезана са личношћу Божијом.
Списи описују Оца, Сина и Светога Духа као три својства једне особе: душу, тело и дух једног Бога. Они такође кажу да се израз „Дух Свети“ појављује у Новом завету јер је повезан са доласком Господа у физичко тело Исусово, и због начина на који је тај долазак променио начин на који можемо да научимо истину Господњу и постанемо добри људи. .
Према Списима, цркве које су дошле пре доласка биле су „репрезентативне“. Људи у њима (ионако у најбољој од тих цркава) су знали да је Господ створио свет и да је свет, дакле, слика Господња, и имали су способност да погледају тај створени свет и разумеју његову духовну поруке; могли су гледати на свет и разумети Господа. И они су то урадили без труда и са великом дубином, слично као што можемо да читамо књигу када је оно што заправо видимо гомилу црних шкриљаца на белом листу папира.
Међутим, та способност је на крају изокренута у обожавање идола и магију, док су људи клизили у зло. Господ је користио децу Израела да сачувају симболичне облике обожавања, али чак ни они нису знали дубље значење ритуала које су следили. Са светом који је тако лишен правог разумевања, Господ је узео људско тело да би могао директно да понуди људима нове идеје. Зато Списи кажу да Он представља божанску истину („Реч постаде тело“, како је речено у Јовану 1:14).
Дух Свети у срцу такође представља божанску истину, истину коју нуди Господ кроз своју службу у свету и њен запис у Новом завету. Термин "Свети Дух" се такође користи у општијем смислу да означава божанску активност и божански ефекат, који кроз истинска учења утичу на наше животе.
Оваква директна веза између Господа и нас није била нешто што би могло доћи преко представника; морао је доћи од Господа као човека који хода земљом током Његовог физичког живота или – у модерним временима – кроз слику коју имамо о Њему као човеку у Његовом физичком животу. Зато људи нису примили Духа Светога пре доласка Господњег.
Међутим, оно што сада имамо је пуна идеја о Господу, са Богом Оцем који представља Његову душу, Сином који представља његово тело, и Светим Духом који представља Његова дела и Његов утицај на људе.
(References: Nauku Novog Jerusalima o Gospodu 58; Istinska Hrišćanska Religija 138, 139, 140, 142, 153, 158, 163, 164, 166, 167, 168, 170, 172)


